Ang Indian Rupee ay may kasaysayan na higit sa 2,500 taon. Ang salitang “rupee” ay nagmula sa Sanskrit na Rupya, na nangangahulugang pilak na barya. Isang standard na rupee coin ang ipinakilala noong ika-16 na siglo ni Sher Shah Suri at patuloy itong ginamit sa panahon ng Mughal Empire.

Sa panahon ng pananakop ng British, naging opisyal na pera ang rupee sa kolonyal na India at ipinakilala ang paper money. Matapos ang kalayaan ng India, nanatili ang rupee bilang pambansang pera at noong 1957, nagpatupad ang India ng decimal system (1 rupee = 100 paise). Sa kasalukuyan, ito ay inilalabas at pinamamahalaan ng Reserve Bank of India.